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Nouvelles

    16 septembre 2010 Soutenance de thèse de Thibaud Boutin.
    Bon à savoir: le CNRS réalise une exposition sur la biodiversité: Plus d'infos.
    Deux équipes du laboratoire ont eu une ANR: Sexdro pour l'équipe de Dominique Joly et Evolbee pour l'équipe de Jean-Christophe Sandoz.

Séminaire à venir

Intervenant  Date  Sujet
Elisabeth HERNIOU (IRBI-Tours) 01-10-2010
11h00		 titre à préciser
Nicolas PUILLANDRE (MNHN) 08-10-2010
11h00		 titre à préciser
Jonathan LOMBARD (ESE-Orsay) 05-11-2010
11h00		 Etait le cenancêtre autotrophe ? Réponses données par l'étude évolutive des carboxylases

Propositions de stages






Stage M2 - 29/07/2010

Influence de la nourriture sur les phéromones de Drosophila melanogaster.



Nom de l'équipe d'accueil :

Génétique Evolutive, Reproduction, Adaptation des Drosophiles



Contacts :

Claude Wicker-Thomas

CNRS UPR 9034, Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation

Avenue de la Terrasse

91198 Gif sur Yvette cedex

Tél. : 01 69 82 37 34

Fax. : 01 69 82 37 36

Mél. : Claude.Wicker-Thomas@legs.cnrs-gif.fr



Encadrement :

Claude Wicker-Thomas, LEGS, CNRS, Gif



Description du stage

Les phéromones jouent un rôle crucial dans le comportement de cour et l’accouplement et sont très dépendantes des conditions extérieures (changements trophiques et thermiques). Dans le cadre d’une ANR, nous étudions l’impact des facteurs trophiques sur les phéromones. Nous utilisons la Drosophile comme insecte modèle.

Nous proposons l’étude de la régulation des gènes de biosynthèse des phéromones par la nourriture et leur évolution chez différentes populations et espèces en en utilisant à la fois des méthodes biochimiques (chromatographie en phase gazeuse), génétiques (mutants RNAi), comportementales et moléculaires.



Profil du candidat

Biologie moléculaire, génétique, évolution.


Références :

  • Wicker-Thomas C, Guenachi I, Keita YF. 2009 Contribution of oenocytes and pheromones to courtship behaviour in Drosophila. BMC Biochem. Aug 11;10:21
  • Gleason J. M., James R. A., Wicker-Thomas C., Ritchie M. G. 2009 Identification of quantitative trait loci function through analysis of multiple cuticular hydrocarbons differing between Drosophila simulans and D. sechellia females. Heredity 103, 416-424.
  • Wicker-Thomas C., Hamann M. 2008 Interaction of dopamine, female pheromones, locomotion and sex behaviour in Drosophila melanogaster. J. Insect Physiol.. 54, 1423-1431.
  • Legendre A., Miao X. X., Da Lage J. L., Wicker-Thomas C. 2008 Evolution of a desaturase involved in female cuticular hydrocarbon biosynthesis and courtship behaviour in Drosophila. Insect Biochem. Molec. Biol. 38, 244-253.


Les mots clefs :
Drosophile, phéromones, désaturases, nourriture, évolution, PCR quantitative .







Stage M2 - 13/07/2010

Conflits sexuels: effets intra- et inter-spécifiques du fluide séminal sur les stratégies d'accouplement des drosophiles.



Nom de l'équipe d'accueil :

Génétique Evolutive, Reproduction, Adaptation des Drosophiles



Contacts :

Dominique Joly

CNRS UPR 9034, Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation

Avenue de la Terrasse

91198 Gif sur Yvette cedex

Tél. : 01 69 82 37 34

Fax. : 01 69 82 37 36

Mél. : dominique.joly@legs.cnrs-gif.fr



Encadrement :

Dominique Joly, LEGS, CNRS, Gif





Description du stage

Le contexte de l'étude concerne les processus de sélection sexuelle post-copulatoire liés notamment au transfert du fluide séminal par le mâle. Chez les espèces à fécondation interne, le fluide séminal est un cocktail complexe de molécules biologiques. Celles-ci sont impliquées dans divers processus qui affectent notamment le comportement et la physiologie de la femelle ainsi que le stockage et l'utilisation des spermatozoïdes. En modifiant leur succès reproducteur elles représentent donc une composante importante de la valeur sélective des mâles.
Ces substances participent du conflit sexuel puisqu'elles augmentent le succès reproducteur d'un sexe au détriment de l'autre. Longtemps ignorés, les effets post-copulatoires ont cependant été observés chez la plupart des groupes taxonomique y compris les vertébrés et sont potentiellement responsables du régime d'accouplement monoandre/polyandre des espèces. Bien étudié chez les insectes, et notamment chez D. melanogaster, on sait cependant encore peu de choses sur la similarité des processus mis en oeuvre chez d'autres espèces caractérisées notamment par des stratégies de reproduction différente. L'objectif de l'étude est d'analyser la réceptivité des femelles après un accouplement dans différentes espèces de drosophiles et de suivre son évolution au cours du temps. Il s'agira de déterminer le rôle de chaque sexe dans le succès à l'accouplement par l'observation des comportements de cour, et de distinguer les variations de la réceptivité femelle liées aux effets transitoires dus aux substances séminales de ceux produits à plus long terme par les spermatozoïdes. Pour chaque espèce, les caractéristiques reproductives des femelles injectées avec du fluide séminal seront comparées à celles des femelles vierges et des femelles accouplées. Des expériences croisées d'injection de fluide séminal de mâles appartenant à une espèce différente de la femelle seront également entreprises. Les résultats permettront de déterminer la spécificité des processus physico-chimiques impliquées et de mieux comprendre le rôle de la manipulation post-copulatoire de la physiologie femelle par le mâle dans l'évolution des stratégies de reproduction.





Profil du candidat

Le contexte de l'étude concerne les processus de sélection sexuelle au niveau post-copulatoire. Il s'agira de discriminer les effets des substances séminales seules de ceux associés aux spermatozoïdes. Ce projet fait partie d'un programme plus large d'étude des signaux chimiques dans les interactions sexuelles postcopulatoires chez les drosophiles, projet soutenu par la Fondation pour la recherche sur la Biodiversité (AAP-IN-2009 EVDYSEM 2010-2011) et l'ANR (ANR-10-01 SexDro 2010-2012).

Aucune pratique expérimentale n'est exigée, le principal travail consistant en observations comportementales. Le(a) candidat(e) devra être autonome pour la gestion des stocks de drosophiles et celle des expériences. Il (elle) assurera les dissections et injections des femelles sous loupe binoculaire. Une bonne connaissance des tests statistiques est recommandée.



Ce stage pourra se poursuivre par une thèse.



Références :

  • Findlay G.D., X. Yi M.J. & W.J. Swanson 2008. Proteomics reveals novel Drosophila seminal fluid proteins transferred at mating. PLoS Biol 6: e178.
  • Kubli E. 2003. Sex-peptides: seminal peptides of the Drosophila male. Cell. Mol. Life Sci. 60: 1689-1704.
  • Liu H., & E. Kubli 2003. Sex-peptide is the molecular basis of the sperm effect in Drosophila melanogaster. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A 100:9929-9933.
  • Luck, N., B. Dejonghe, S. Fruchard, S. Huguenin & D Joly 2007. Male and female effects on sperm precedence in the giant sperm species Drosophila bifurca. Genetica 130:257-265.
  • Mueller, J. L., D. R. Ripoll, C. F. Aquadro, & M. F. Wolfner 2004. Comparative structural modeling and inference of conserved protein classes in Drosophila seminal fluid. Proc Natl Acad Sci U S A 101:13542-13547.
  • Luck, N., B. Dejonghe, S. Fruchard, S. Huguenin & D Joly 2007. Male and female effects on sperm precedence in the giant sperm species Drosophila bifurca. Genetica 130:257-265.
  • Mueller, J.L., K.R. Ram, L.A.. McGraw, M.C. Bloch Qazi, E.D., Siggia, A.G. Clark, C.F. Aquadro & M.F. Wolfner 2005. Cross-species comparison of Drosophila male accessory gland protein genes. Genetics 171: 131-143.
  • Peng, J., Chen, S., Busser, S., Liu, H., Honegger, T. & E. Kubli 2005. Gradual release of sperm bound sex-peptide controls female postmating behavior in Drosophila. Curr. Biol. 15: 207-213.
  • Ram, K.R., & M.F. Wolfner 2007. Sustained post-mating response in Drosophila melanogaster requires multiple seminal fluid proteins. PLOS Genet 3: e238
  • Wedell N. 2005. Female receptivity in butterflies and moths. J. Exp. Biol. 208: 3433-3440.
  • Wigby, S., Sirot, L.K., Linklater, J.R., Buehner, N., Calboli, F.C., Bretman, A., Wolfner, M.F. & T. Chapman. 2009. Seminal fluid protein allocation and male reproductive success. Curr Biol 19, 751-757.

    • Les mots clefs :

    Sélection sexuelle, conflits sexuels, fluide séminal, réceptivité, drosophile, ACPs, accouplements multiples.








Stage M2 - 13/07/2010

Caractérisation par immunodétection de la dynamique d'adhésion de protéines du fluide séminal au spermatozoïde dans les voies génitales femelles chez la drosophile



Nom de l'équipe d'accueil :

Génétique Evolutive, Reproduction, Adaptation des Drosophiles



Contacts :

Dominique Joly

CNRS UPR 9034, Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation

Avenue de la Terrasse

91198 Gif sur Yvette cedex

Tél. : 01 69 82 37 34

Fax. : 01 69 82 37 36

Mél. : Ecrire à Dominique Joly



Encadrement :

Dominique Joly, LEGS, CNRS, Gif





Description du stage

Chez les espèces sexuées, le succès reproducteur d'un mâle dépend principalement de l'attractivité de la femelle et de sa réceptivité à un accouplement. Ces facteurs sont sous le contrôle de signaux chimiques génétiquement déterminés; ces derniers agissent sur la physiologique de la femelle (diminution de sa réceptivité à un accouplement ultérieur et augmentation de la ponte) de telle sorte qu'ils favorisent l'assurance de paternité. Les protéines du fluide séminal (Sfps) jouent à cet égard un rôle extrêmement important aussi bien chez les vertébrés, y compris l'Homme, que chez les invertébrés.

Chez les drosophiles, le peptide sexuel, Acp70A sécrété par les glandes accessoires du mâle, a été particulièrement bien étudié et caractérisé fonctionnellement. Il a été montré que la durée d'inhibition de la réceptivité femelle dépendait de la dynamique d’adhésion de ce peptide aux spermatozoïdes dans les voies génitales femelles: le spermatozoïde sert de "réservoir" à peptide sexuel, lequel est libéré au fur et à mesure du temps. À ce jour, ces processus d'adhésion et de libération du peptide sexuel du spermatozoïde n'ont été décrits que chez l'espèce D. melanogaster. Afin de déterminer si les mêmes processus sont à l'œuvre dans d'autres espèces, nous proposons d'étudier au cours de ce stage la dynamique d'accroche des orthologues de l’Acp70A dans les 8 espèces les plus proches appartenant au sous-groupe melanogaster. L'intérêt de ce groupe taxonomique réside dans la diversité des stratégies d'accouplement des espèces (certaines comme D. melanogaster ayant une diminution de la réceptivité bien plus faible que d'autres comme D. santomea) et dans la diversité des systèmes spermatiques (certaines ayant des spermatozoïdes longs, cf D. yakuba, d'autres plutôt courts, cf D. mauritiana). Cette diversité permet de tester le rôle de transporteur et de réservoir à peptides sexuels du spermatozoïde dans les différentes espèces.

Jusqu’à présent, nos études ont consisté à caractériser chez les 8 autres espèces les séquences orthologues de l’Acp70A et à valider l’expression de ces gènes dans les glandes accessoires des mâles. L’emploi d’un anticorps dirigé contre l’Acp70A de D. melanogaster nous a permis d’immuno-détecter les orthologues chez toutes les espèces sauf une, et d’attester leur présence dans les éjaculats récoltés chez les femelles peu après leur accouplement. Il s'agit maintenant de réaliser une caractérisation spatio-temporelle de l’adhésion de l’Acp70A au spermatozoïde durant leur stockage chez les femelles des différentes espèces.

Ce projet fait partie d'un programme plus large d'étude des signaux chimiques dans les interactions sexuelles postcopulatoires chez les drosophiles, projet soutenu par la Fondation pour la recherche sur la Biodiversité (AAP-IN-2009 EVDYSEM 2010-2011) et l'ANR (ANR-10-01 SexDro 2010-2012).





Profil du candidat

Des connaissances en biochimie, biologie moléculaire seront appréciées.
L’étudiant(e) sera autonome dans la gestion des stocks de drosophiles, réalisera les accouplements, les diverses dissections sous loupe binoculaire, ainsi que les techniques immunologiques de westernblot et d'immunofluorescence. Il bénéficiera de l'encadrement technique de l'équipe.



Ce stage pourra se poursuivre par une thèse.



Références :

  • Findlay G.D., X. Yi M.J. & W.J. Swanson 2008. Proteomics reveals novel Drosophila seminal fluid proteins transferred at mating. PLoS Biol 6: e178.
  • Kubli E. 2003. Sex-peptides: seminal peptides of the Drosophila male. Cell. Mol. Life Sci. 60: 1689-1704.
  • Liu H., & E. Kubli 2003. Sex-peptide is the molecular basis of the sperm effect in Drosophila melanogaster. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A 100:9929-9933.
  • Luck, N., B. Dejonghe, S. Fruchard, S. Huguenin & D Joly 2007. Male and female effects on sperm precedence in the giant sperm species Drosophila bifurca. Genetica 130:257-265.
  • Mueller, J. L., D. R. Ripoll, C. F. Aquadro, & M. F. Wolfner 2004. Comparative structural modeling and inference of conserved protein classes in Drosophila seminal fluid. Proc Natl Acad Sci U S A 101:13542-13547.
  • Luck, N., B. Dejonghe, S. Fruchard, S. Huguenin & D Joly 2007. Male and female effects on sperm precedence in the giant sperm species Drosophila bifurca. Genetica 130:257-265.
  • Mueller, J.L., K.R. Ram, L.A.. McGraw, M.C. Bloch Qazi, E.D., Siggia, A.G. Clark, C.F. Aquadro & M.F. Wolfner 2005. Cross-species comparison of Drosophila male accessory gland protein genes. Genetics 171: 131-143.
  • Peng, J., Chen, S., Busser, S., Liu, H., Honegger, T. & E. Kubli 2005. Gradual release of sperm bound sex-peptide controls female postmating behavior in Drosophila. Curr. Biol. 15: 207-213.
  • Ram, K.R., & M.F. Wolfner 2007. Sustained post-mating response in Drosophila melanogaster requires multiple seminal fluid proteins. PLOS Genet 3: e238
  • Wedell N. 2005. Female receptivity in butterflies and moths. J. Exp. Biol. 208: 3433-3440.
  • Wigby, S., Sirot, L.K., Linklater, J.R., Buehner, N., Calboli, F.C., Bretman, A., Wolfner, M.F. & T. Chapman. 2009. Seminal fluid protein allocation and male reproductive success. Curr Biol 19, 751-757.


Les mots clefs :

Conflits sexuels, fluide séminal, Acps, peptides sexuels, protéines de liaison, réponse comportementale, westernblot, immunodetection, drosophile.








Stage M2 - 01/10/2009

Evolution du chromosome Y chez les drosophiles



Nom de l'équipe d'accueil :

Spéciation chez les drosophiles



Contacts :

Sylvie Aulard-Widemann

CNRS UPR 9034, Laboratoire Evolution,Génomes et Spéciation

Avenue de la Terrasse

91198 Gif sur Yvette cedex

Tél. : 01 69 82 37 35

Fax. : 01 69 82 37 36

Mél. : Sylvie.Aulard@legs.cnrs-gif.fr



Description du sujet :

L’organisation et le contenu en gènes du chromosome Y des drosophiles restent encore mal connus du fait de sa structure entièrement hétérochromatique et de son mode de transmission clonal, qui empêchent toute approche génétique classique. Le récent séquençage de génomes entiers ainsi que l’évolution des techniques de cytogénétique permettent de mieux explorer son contenu et d’aborder ainsi la question de son origine et de son évolution.

Les travaux réalisés par l’équipe visent à une meilleure connaissance de l’évolution de ce chromosome au sein du sous-groupe melanogaster. Le stage consistera à étudier les remaniements survenus au cours de l'évolution et à repérer en particulier les évènements de perte ou gain de gènes. Les techniques utilisées sont celles de la génétique moléculaire et de la cytogénétique. Elles s'appuieront sur l'hybridation in situ de sondes correspondant à des gènes de fertilité déjà identifiés sur le chromosome Y de l’espèce Drosophila melanogaster.



Perspective à l'issue du stage :

Ce stage pourra se poursuivre par une thèse.



Références :

  • Roy V., Monti-Dedieu L., Chaminade N., Siljak-Yakovlev S., Aulard S ., Lemeunier F. & C. Montchamp-Moreau. 2005 Evolution of the chromosomal location of rDNA genes in two Drosophila species subgroups : ananassae and melanogaster. Heredity, 94:388-395.


  • Aulard S., L. Monti, N. Chaminade and F. Lemeunier. 2004 Mitotic and polytene chromosomes: comparisons between Drosophila melanogaster and Drosophila simulans. Genetica 120: 137-150.


  • Kopp A, Frank AK, Barmina O. 2006 Interspecific divergence, intrachromosomal recombination, and phylogenetic utility of Y-chromosomal genes in Drosophila. Mol Phylogenet Evol., 38(3):731-41.


Les mots clefs :

Evolution chromosomique, chromosomes sexuels, drosophile.



Stage M2 - 16/07/2010

Variation de l’activité transcriptionnelle des éléments transposables en conditions de stress




Nom de l'équipe d'accueil :

Eléments Génétiques Mobiles



Contacts :

Pierre Capy

CNRS UPR 9034, Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation

Avenue de la Terrasse

91198 Gif sur Yvette cedex

Tél. : 01 69 82 37 35

Fax. : 01 69 82 37 36

Mail. : pierre.capy@legs.cnrs-gif.fr



Description du sujet :

Les éléments transposables (ET) sont des séquences d’ADN mobile présents dans tous les génomes, en proportion variable (15% chez la drosophile, 45 % chez l’homme). Ils sont des acteurs majeurs de l’évolution des génomes. Habituellement ils sont faiblement actifs, mais peuvent être réactivés par des stress divers biotiques ou abiotiques tels que la température, les UV, la culture cellulaire, les attaques pathogènes. Cette réactivation, en engendrant une augmentation de la variabilité génétique dans la population, participe à l’adaptabilité du génome et donc à son évolution.
L’objectif du stage est d’analyser les variations d’expression d’un élément transposable en conditions de stress, chez un organisme modèle, la Drosophile et plus particulièrement chez l’espèce cosmopolite Drosophila simulans. Des résultats préliminaires montrent que des stress thermiques (froid et chaud) peuvent modifier le niveau d’expression d’un élément transposable (mariner) dans certaines populations naturelles. Par ailleurs, il semble que les modifications d’expression observées sur les individus stressés soient transmissibles à la génération suivante. Nous avons également mis en évidence que cette expression varie en fonction des stades, des tissus et du sexe. Pratiquement, dans le cadre de ce stage, il faudra déterminer si un stress appliqué à une génération donnée peut avoir des effets sur les descendants et ceci pendant plusieurs générations. Ceci permettra d’aborder la dimension épigénétique de ces modifications d’expression. Il faudra également tester si ces changements affectent de la même façon tous les stades de développement de l’œuf à l’adulte, les différents tissus et les deux sexes.



Perspective à  l'issue du stage :

Ce stage pourra se poursuivre par une thèse.


Références :

  • Capy P. , Gasperi G. , C. Biémont C., Bazin C. 2000. Stress and transposable elements: co-evolution or useful parasites? Heredity. 85: 101-106.

  • Picot S, Wallau GL, Loreto ELS, Heredia FO, Hua-Van A, Capy
    P. 2008. The mariner transposable element in natural populations of Drosophila simulans.
    Heredity. 101, 53-59.

  • Wicker T, Sabot F, Hua-Van A, Bennetzen JL, Capy P, Chalhoub B, Flavell A, Leroy P, Morgante M, Panaud O, et al. 2007. A unified classification system for eukaryotic transposable elements. Nat Rev
    Genet 8:973-982
  • Slotkin RK, Martienssen R 2007.Transposable elements and the epigenetic regulation of the genome. Nat Rev Genet 8:272-285



Profil du candidat

Des connaissances en génétique, biologie moléculaire et évolution seront
appréciées.L'étudiant(e) devra entretenir les différentes lignées de drosophiles, aplliquer les stress thermiques etréaliser des RT-PCR quantitative



Les mots clefs :
Eléments transposables, Expression, Stress, drosophile.